在不断的研究古代遗迹跟解锁神兽的途中，塞尔达公主与林克的关系也重归于好，并且开始关心林克询问他为什么也一直沉默寡言。
而通过交谈，塞尔达公主也知道了。
原来林克是因为自己已经是被大师剑承认的勇者而倍感压力，决定沉默寡言不将情感轻易表露于外。
这时候塞尔达公主这时才觉得他与自己竟是如此相像。
不过一旁粗线条的达尔克尔，却把公主口中的如此相像，理解为了喜欢吃的东西一样。
并且揭露出了林克的一个设定，那就是林克是个大胃王，什么都吃什么都能吃。
而这也为后面留下了一段珍贵的回忆，这也是整个游戏剧情中为数不多温馨的画面。
前往海拉鲁王国城堡附近，这时候塞尔达已经知道林克是个大胃王了，于是她拿起手中的青蛙，要林克表演吞下去。
在一番慷慨陈词，叙述吞青蛙对海拉鲁有多少帮助跟贡献时。
可以看到塞尔达公主低头抿嘴时，脸上带着一丝坏笑，流露出本该属于她这个年纪的活泼可爱。
在这里塞尔达公主与林克开心地玩闹，毕竟此时两人已是知道彼此秘密十分要好的朋友了。
当然除了这温馨的一幕，在这里还提及了贯穿游戏始终的植物：静谧公主。
这种花美丽而脆弱，虽然塞尔达公主努力研究，可是似乎仍无法避免它灭绝的命运。
可在游戏中当玩家前往塞尔达公主的研究室中，就会发现一朵美丽的静谧公主，坚强而不合时宜地开放在这里，宛若独自在城堡中对抗盖农的塞尔达公主。
但快乐也只是短暂的，很快塞尔达陷入了悲伤地情绪，因为塞尔达的压力不仅仅源于自己，同样还来源于家庭。
国王称塞尔达将精力投入在古物之上，是不务正业。
可只有塞尔达明白，无论她怎么努力，封印之力始终没有办法觉醒，所以她才开始研究古代遗迹来打败盖侬。
而四神兽与四英杰的出现，同样也来源于塞尔达公主的努力，但即便如此皇宫内那些大臣还是充满闲言碎语，称塞尔达是不学无术的公主。
不过较为讽刺的是在之后玩家们能够得到两种菜谱，根据说明能够得知。
喜欢水果蛋糕的塞尔达公主，是因为这个菜谱吃了之后会令头脑清明，有利于研究古物。
而大臣们喜欢的则是用怪物精华制作的怪物蛋糕，因为吃完了以后会头脑混沌，精力充沛。
但最终她所做的也都是徒劳，盖侬复活了，杀死了四英杰和国王。
海拉鲁王国似乎还是不可避免的走向了灭亡。
而这个时候的塞尔达依旧没有觉醒封印之力。
‘都是我的错，都是因为我无法觉醒封印之力……所以才让本该用来对付盖侬的古物被夺走。’
‘我……至今所做的一切……没有起到任何的帮助，是我把所有人都害死了！害死了国民，害死了同伴……害死了父亲……’
从城堡中林克护卫着塞尔达逃了出来，森林中磅礴的大雨拍打在塞尔达恸哭的背影上。
林克一路带着塞尔达公主，在守护者的重重包围下。
从海拉鲁平原，穿越双子山，一路杀到了卡卡利科村附近。
但一路上的战斗已经让林克重伤力竭，最终当守护者搜寻到两人的踪迹，决定以激光毁灭林克时。仿佛是上天给塞尔达开了个玩笑，在这几乎是失去了一切的情况下，封印之力觉醒了。
不过在这绝望之际，塞尔达公主发现林克仍有一息尚存，破损的大师剑中精灵的声音指导塞尔达公主，如何保全林克的性命。
于是这时候的塞尔达做出了清醒的判断，安排赶来的希卡族人带着希卡之石将林克安顿至复苏神庙。自己则听从大师剑的指引，回到森林之中将其重新插回台座。
塞尔达坚信，苏醒后的林克即使失去了全部记忆，仍然会来到这里，重新找到大师之剑。
而她自己则一个人重新朝着海拉鲁城堡前进，去与盖侬继续战斗。
直到林克苏醒。
一开始很多玩家都觉得塞尔达就是个推进剧情工具人而已。
公主？有什么好救的？
一百年都过去了，再等等呗。
可当玩家找寻到这些遗失的记忆，感受到塞尔达的努力跟无奈后。
所有玩家就只有一个念头，我要打爆盖侬的狗头！我一定要救出塞尔达！